| RUNX3 | Q13761 | AC083973.1-205 | ENST00000518994 | 601 nt | TSL 2 BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | APOOP3-201 | ENST00000536787 | 586 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FRG2DP-202 | ENST00000566967 | 323 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL356280.1-201 | ENST00000603614 | 379 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001836.1-201 | ENST00000604675 | 523 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC023490.1-201 | ENST00000614584 | 375 nt | TSL 2 BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011718.1-201 | ENST00000622906 | 375 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01938-201 | ENST00000521341 | 1864 nt | TSL 2 BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CFHR4-202 | ENST00000367416 | 2178 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-529P-201 | ENST00000363383 | 104 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.404-201 | ENST00000383978 | 102 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA6-201 | ENST00000384033 | 151 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU1-52P-201 | ENST00000384190 | 164 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-43P-201 | ENST00000384302 | 107 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-601P-201 | ENST00000384540 | 107 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR544A-201 | ENST00000384855 | 91 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-220P-201 | ENST00000390919 | 107 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U6atac.2-201 | ENST00000408644 | 118 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.594-201 | ENST00000410373 | 140 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-370P-201 | ENST00000411008 | 104 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093382.1-201 | ENST00000413311 | 379 nt | TSL 5 BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02331-201 | ENST00000418927 | 602 nt | TSL 5 BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EIF1AXP1-201 | ENST00000419267 | 435 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EIF4EP4-201 | ENST00000424916 | 578 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008267.5-201 | ENST00000424928 | 265 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004869.2-201 | ENST00000436501 | 229 nt | TSL 3 BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC003989.2-201 | ENST00000440224 | 169 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091153.2-202 | ENST00000441700 | 384 nt | TSL 3 BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009468.2-201 | ENST00000457372 | 366 nt | TSL 5 BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.632-201 | ENST00000459189 | 102 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | snoU13.14-201 | ENST00000459372 | 104 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL7P42-201 | ENST00000481005 | 679 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SMURF2P1-201 | ENST00000514992 | 481 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6ATAC12P-201 | ENST00000516542 | 115 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1016P-201 | ENST00000516689 | 94 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02155-201 | ENST00000519215 | 407 nt | TSL 5 BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022784.2-201 | ENST00000521298 | 328 nt | TSL 2 BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022690.2-201 | ENST00000525673 | 589 nt | TSL 3 BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010186.2-204 | ENST00000537668 | 439 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02293-201 | ENST00000548335 | 574 nt | TSL 5 BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL136038.2-201 | ENST00000553983 | 283 nt | TSL 3 BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC105245.1-201 | ENST00000581934 | 244 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR3117-201 | ENST00000584034 | 78 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC113139.1-201 | ENST00000605049 | 239 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC018462.2-201 | ENST00000605375 | 395 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC124303.1-201 | ENST00000605703 | 360 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC098657.3-201 | ENST00000620434 | 263 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C16orf97-206 | ENST00000622950 | 415 nt | TSL 2 BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA43.4-201 | ENST00000629559 | 138 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND4LP32-201 | ENST00000636111 | 270 nt | BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CALCRL-201 | ENST00000392370 | 5155 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RRAS2-211 | ENST00000537760 | 2034 nt | TSL 2 BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TBL1XR1-208 | ENST00000430069 | 7948 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.95 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LRRCC1-202 | ENST00000414626 | 4493 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KPNA2P1-201 | ENST00000458289 | 1591 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-79P-201 | ENST00000362764 | 141 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.61-201 | ENST00000362835 | 102 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1285P-201 | ENST00000363480 | 105 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.338-201 | ENST00000365320 | 114 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU1-57P-201 | ENST00000384491 | 166 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1072P-201 | ENST00000384703 | 107 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-443P-201 | ENST00000384780 | 107 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR186-201 | ENST00000384988 | 86 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR218-1-201 | ENST00000384999 | 110 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4ATAC16P-201 | ENST00000408512 | 126 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYCSP48-201 | ENST00000417124 | 323 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AIMP1P2-201 | ENST00000425294 | 312 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL23AP95-201 | ENST00000426806 | 265 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL445687.1-201 | ENST00000439946 | 251 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL442638.1-201 | ENST00000443359 | 237 nt | TSL 5 BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MAMDC2-AS1-205 | ENST00000451488 | 317 nt | TSL 3 BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCMTD1P1-201 | ENST00000455560 | 355 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD5.1-201 | ENST00000458800 | 75 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.635-201 | ENST00000459041 | 101 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC080013.2-201 | ENST00000460866 | 323 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FO393415.2-201 | ENST00000480085 | 343 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC023141.11-201 | ENST00000508864 | 202 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091976.1-202 | ENST00000509211 | 630 nt | TSL 3 BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-559P-201 | ENST00000516151 | 98 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP005902.1-201 | ENST00000521358 | 186 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL139193.1-201 | ENST00000554967 | 539 nt | TSL 4 BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC025580.2-205 | ENST00000559960 | 552 nt | TSL 4 BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC020910.1-201 | ENST00000599404 | 413 nt | TSL 5 BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073410.2-201 | ENST00000603240 | 332 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009229.3-201 | ENST00000608056 | 282 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND4P27-201 | ENST00000450813 | 1354 nt | BASIC | 1.94 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF720P1-201 | ENST00000562403 | 1939 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TDRD15-202 | ENST00000622654 | 5805 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC069228.1-201 | ENST00000546936 | 1615 nt | TSL 3 BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD50.1-201 | ENST00000362987 | 71 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-797P-201 | ENST00000363101 | 109 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1188P-201 | ENST00000363795 | 107 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DEFB134-201 | ENST00000382205 | 314 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.394-201 | ENST00000383942 | 103 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA36A-201 | ENST00000384221 | 132 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-790P-201 | ENST00000384479 | 105 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1222P-201 | ENST00000384615 | 107 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR521-1-201 | ENST00000384902 | 87 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1106P-201 | ENST00000390845 | 107 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU2-20P-201 | ENST00000410425 | 191 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |