Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL4AQ13619 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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CUL4AQ13619 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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CUL4AQ13619 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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CUL4AQ13619 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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CUL4AQ13619 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL4AQ13619 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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