Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ATRQ13535 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ATRQ13535 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ATRQ13535 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATRQ13535 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATRQ13535 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms