Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BFSP2Q13515 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.8 ms