Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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TOP3AQ13472 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
TOP3AQ13472 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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