Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms