Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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