Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3BQ13214 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3BQ13214 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms