Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms