Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms