Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED1O96006 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ZBED1O96006 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED1O96006 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED1O96006 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED1O96006 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED1O96006 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED1O96006 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED1O96006 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED1O96006 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED1O96006 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED1O96006 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED1O96006 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED1O96006 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED1O96006 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED1O96006 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED1O96006 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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