Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LRRTM2O43300 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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