Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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