Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TIMMDC1Q9NPL8 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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