Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms