Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.43□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
COL24A1Q17RW2 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.7 ms