Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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CCDC6Q16204 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CCDC6Q16204 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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CCDC6Q16204 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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CCDC6Q16204 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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CCDC6Q16204 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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CCDC6Q16204 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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