Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms