Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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VAMP3Q15836 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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VAMP3Q15836 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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VAMP3Q15836 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.78□□□□□ -2.28
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VAMP3Q15836 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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