Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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SIX1Q15475 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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SIX1Q15475 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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SIX1Q15475 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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SIX1Q15475 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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SIX1Q15475 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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SIX1Q15475 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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