Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NR1I3Q14994 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.5 ms