Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
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GPNMBQ14956 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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GPNMBQ14956 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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GPNMBQ14956 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPNMBQ14956 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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