Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RRP1BQ14684 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RRP1BQ14684 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms