Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF2H2Q13888 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF2H2Q13888 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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