Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALCAMQ13740 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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