Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CUL1Q13616 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms