Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms