Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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ITGB3BPQ13352 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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ITGB3BPQ13352 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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ITGB3BPQ13352 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
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ITGB3BPQ13352 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ITGB3BPQ13352 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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