Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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ERCC8Q13216 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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ERCC8Q13216 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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ERCC8Q13216 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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ERCC8Q13216 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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ERCC8Q13216 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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ERCC8Q13216 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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ERCC8Q13216 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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ERCC8Q13216 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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ERCC8Q13216 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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