Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
CBX3Q13185 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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