Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPS1Q13098 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms