Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
TRAF1Q13077 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms