Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.44□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
BPTFQ12830 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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