Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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TM4SF4P48230 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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TM4SF4P48230 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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TM4SF4P48230 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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TM4SF4P48230 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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TM4SF4P48230 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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TM4SF4P48230 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM4SF4P48230 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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