Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
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