Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
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