Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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VN1R3Q9BXE9 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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VN1R3Q9BXE9 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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VN1R3Q9BXE9 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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VN1R3Q9BXE9 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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VN1R3Q9BXE9 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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