Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TXNRD1Q16881 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TXNRD1Q16881 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TXNRD1Q16881 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TXNRD1Q16881 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TXNRD1Q16881 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TXNRD1Q16881 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TXNRD1Q16881 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TXNRD1Q16881 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TXNRD1Q16881 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms