Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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PTPROQ16827 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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PTPROQ16827 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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PTPROQ16827 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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