Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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