Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.26□□□□□ -2.45
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HERC1Q15751 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
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