Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms