Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H3Q13889 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H3Q13889 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H3Q13889 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H3Q13889 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H3Q13889 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H3Q13889 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H3Q13889 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H3Q13889 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H3Q13889 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H3Q13889 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H3Q13889 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H3Q13889 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H3Q13889 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H3Q13889 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H3Q13889 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H3Q13889 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H3Q13889 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H3Q13889 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H3Q13889 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H3Q13889 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H3Q13889 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GTF2H3Q13889 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GTF2H3Q13889 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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