Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PEX6Q13608 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PEX6Q13608 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PEX6Q13608 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PEX6Q13608 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PEX6Q13608 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PEX6Q13608 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PEX6Q13608 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PEX6Q13608 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PEX6Q13608 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PEX6Q13608 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PEX6Q13608 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PEX6Q13608 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PEX6Q13608 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms