Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.4□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms