Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HDAC1Q13547 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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