Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
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TMED1Q13445 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC0.72□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.72□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMED1Q13445 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
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TMED1Q13445 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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TMED1Q13445 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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TMED1Q13445 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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TMED1Q13445 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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