Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SP140Q13342 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SP140Q13342 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SP140Q13342 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SP140Q13342 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
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SP140Q13342 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SP140Q13342 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SP140Q13342 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SP140Q13342 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SP140Q13342 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SP140Q13342 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SP140Q13342 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SP140Q13342 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SP140Q13342 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SP140Q13342 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SP140Q13342 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SP140Q13342 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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SP140Q13342 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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SP140Q13342 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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SP140Q13342 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SP140Q13342 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SP140Q13342 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SP140Q13342 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SP140Q13342 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
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SP140Q13342 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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SP140Q13342 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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SP140Q13342 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SP140Q13342 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SP140Q13342 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SP140Q13342 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SP140Q13342 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SP140Q13342 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SP140Q13342 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SP140Q13342 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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SP140Q13342 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SP140Q13342 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SP140Q13342 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SP140Q13342 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SP140Q13342 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SP140Q13342 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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