Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TRAF3Q13114 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TRAF3Q13114 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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