Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1BQ13112 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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CHAF1BQ13112 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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CHAF1BQ13112 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1BQ13112 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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